Холмс расследует проникновение со взломом. Хозяин дома заявляет об исчезновении жены.
Кто-то убивает незаконнорожденных детей богатого бизнесмена. Под подозрение попадает законная дочь бизнесмена, но у неё железное алиби — кома.
Шерлок и Ватсон занимаются делом о похищении ребёнка, в котором замешан серийный убийца по прозвищу «Человек с шариками». Фирменный знак преступника — связка воздушных шаров, всегда остающаяся на месте преступления.
Холмс разыскивает пропавшего финансиста крупной инвестиционной компании. В ходе расследования открывается целая серия преступлений, жертвой одного из которых чуть не становится сам Шерлок. Ему удаётся спастись, используя дедуктивные способностям Джоан, которые она тренирует и применяет в том числе и на серии свиданий.
Преступник убивает в больнице пациентов, находящихся при смерти, обставляя всё так, как будто они умерли по естественным причинам. Параллельно Холмс узнаёт подробности, касающиеся решения Джоан отказаться от карьеры хирурга.
Шерлок находит странные обстоятельства крушения небольшого самолёта — пассажир умер до аварии. Тем временем Джоан уговаривает Шерлока встретиться с отцом.
Шерлок расследует двойное убийство, своим почерком напоминающее серию убийств тринадцатилетней давности. Тем временем Ватсон посещает реабилитационный центр, в котором пребывал Холмс, и узнаёт о его отношениях с Ирэн Адлер.
Расследуя взрыв в офисе, Шерлок раскрывает преступление, которое долгие годы оставалось неизвестным. В это время Ватсон склоняет Холмса найти ей замену.
Профессор колледжа убит двумя выстрелами в глаза. Детектив Маркус Белл помогает Холмсу выйти на подпольное китайское казино, но Шерлока не устраивает версия убийства с целью ограбления — слишком уж вычурным выглядит способ убийства. Джоан же самостоятельно разбирается с угоном автомобиля, спасая своего бывшего парня-наркомана от ложного обвинения.
От Шерлока требуется расследование вскрытия банковского хранилища под названием «Левиафан», которое считали неприступным. Тем временем Джоан приятно удивлена, когда Шерлок встречается с её семьёй и поддерживает её решение стать куратором трезвости для реабилитирующихся.