Сюжет фильма разворачивается в 1917 году. В стране бушует гражданская война, надвигается угроза контрреволюции. По личному поручение Владимира Ленина Камо должен доставить из Петрограда в Тифлис бумагу с назначением Степана Шаумяна чрезвычайным комиссаром по делам Кавказа, а так же крупную сумму золотом на борьбу с белогвардейцами. Камо решает ехать самым коротким и при этом самым опасным путем — через районы, оккупированные Белыми войсками. «Чрезвычайное поручение» — второй фильм из революционной кинотрилогии о Семене Тер-Петросяне по прозвищу Камо.