СССР, начало 1930-х годов. На нижнелиманском кораблестроительном заводе появился шпион, распространяющий секретную информацию. Чтобы найти и обезвредить негодяя, руководство завода вызывает знаменитого чекиста Каротина. Он приезжает в Нижнелиманск под видом ученого и принимается за дело. Его местные, еще не опытные помощники скорее мешают ходу расследования, суя свой нос не туда, куда следует, и попадая в разного рода комические ситуации. Впрочем, это не мешает Каротину в конце концов докопаться до истины... Сюжет фильма «А был ли Каротин?» основан на реальных событиях.