Юрий Тарханов — бывший боец спецназа, а ныне — руководитель команды государственных инспекторов «Рысь». Вместе со своими коллегами он вступает в непримиримую борьбу с криминальными структурами, «поделившими» между собой озеро Байкал. Пользуясь связями с нечистыми на руку сотрудниками правоохранительных органов, браконьеры десятилетиями уничтожали промысловую рыбу омуль, нанося серьезный урон экосистеме Байкала. Тарханов ведет войну с браконьерами, бандитами и олигархами, которые не готовы так просто отдавать свой многомиллионный бизнес.
Сюжет сериала основан на реальной истории «заповедного спецназа» — группы «Баргузин» и ее руководителя Артура Мурзаханова.