Действие сериала «Колония» разворачивается в ближайшем будущем. Лос-Анджелес оказывается территорией, оккупированной пришельцами, которые ставят под угрозу выживание человечества. Многие понимают это и, несмотря на риск, пытаются бороться с оккупантами, иногда расплачиваясь собственной головой. Другие идут на сотрудничество с новой властью, извлекая из этого личную выгоду и добиваясь привилегий для себя и своих близких.