На планете разразилась пандемия смертельного заболевания, которая уничтожила 80% населения Земли. Экипажу одиноко плавающего в океане эсминца удается избежать заболевания. Теперь на их плечи ложится ответственность по спасению оставшихся в живых людей.
«Последний корабль» — это американская версия популярного испанского сериала «Ковчег», вышедшего на экраны в 2011 году.