Питер Паркер — самый обычный 19-летний студент, который учится в госуниверситете на первом курсе. Но это лишь на первый взгляд. На самом деле Паркер — очень необычный студент, так как в парне слились воедино две очень разные личности — Питер Паркер и Человек-паук. Мультсериал «Человек-паук» начинается с того момента, как Питер уже получил сверхспособности.
Паркер в свободное от учебы время подрабатывает внештатным фотографом в редакции местной газеты «Дейли Бьюгл», и по совместительству — спасает страждущих от всякого рода злодеев. Паркер считает, что это его призвание и долг, раз уж судьба распорядилась так, что именно ему были дарованы уникальные способности.
В мультсериале Человеку-пауку придется сразиться практически со всеми злодеями классических комиксов. Здесь бесчинствуют Зеленый Гоблин, Ящер, Амбал, Доктор Осьминог, Скорпион, Носорог, Стервятник, Мистерио, Хамелион и Шокер. Но появились и новые злодеи — Карнаж, Хобгоблин, Веном.