У «тайфунов» большие перемены. Уходит в отставку руководитель группы Петрович. На его место назначают Батю. Багира уходит в отпуск по беременности. Для пополнения рядов в центр подготовки прибывают два кандидата: капитан-лейтенант Александр Бурлак и лейтенант Лариса Павлова. Лариса Павлова направлена с Каспийской флотилии, с Бурлаком же всё как-то туманно. По словам Бати, появился он «по настоятельной рекомендации ФСБ. Очень скоро для проверки боевых качеств новых»тайфунов"найдётся повод. По имеющимся у ФСБ достоверным данным на близкое к президенту лицо готовится покушение.
В Россию прибывает с деловым визитом премьер-министр некой африканской страны. Высокого гостя принимают в Санкт-Петербурге. Во время прогулки по Финскому заливу, к обеспечению безопасности гостя привлекают отряд «Тайфун» в лице Бизона и Барса. Они фиксируют преследующий прогулочный катер неопознанный надводный объект — по их мнению, это торпеда! Время на раздумья нет. Барс прыгает в воду.
Украинская подводная лодка, шедшая своим ходом на утилизацию, затонула. Над местом аварии стоит военный корабль украинских ВМС. Идёт операция по спасению экипажа подлодки. Часть экипажа спасли. На лодке остались пять человек, один из них ранен. Украинские моряки обращаются за помощью к соседям — Черноморскому флоту России. К месту аварии на вертолёте прибывает отряд «Тайфун»... Отряд «Тайфун» отрабатывает действия в условиях городских подземных коммуникаций. Очень скоро их умение пригодится на практике.
В Петербург прибывает президент крупного японского концерна для заключения важного для города контракта. Конкуренты через коррумпированного депутата Городской думы Салтыковского стремятся помешать этому и заказывают похищение именитого японца Туркову — лидеру бандитской группировки неонацистского толка, скрывающейся под вывеской клуба диггеров «Хабар».
Сухогруз «Капитан Шаронов» возвращается в родной порт — Петербург. Но не только родные и близкие моряков готовятся встретить судно. Спецслужбы нескольких стран проводят совместную операцию, имеющую цель ликвидировать морской наркотрафик из Скандинавии. Известно, что на судне «Капитан Шаров» под видом фармацевтической продукции везут большую партию наркотиков. Необходимо взять преступников с поличным.
В одной из европейских стран «провалился» агент нашей разведки «Данаец». От ареста ему удалось уйти, он вынужден скрываться, но местные спецслужбы висят у него на хвосте, и окончательная поимка Данайца вопрос времени. Город, где скрывается агент, портовый, с разветвлённой сетью водных артерий. Руководство нашей разведки решает эвакуировать Данайца водным путём. К операции, которой присвоено название «Данаец», привлекаются бойцы отряда «Тайфун».
Российский военный самолет потерпел аварию над Балтийским морем. Летчик катапультировался, самолет упал в воду. Все произошло в территориальных водах Эстонии. Летчик спасен и арестован до выяснения обстоятельств аварии. Главный вопрос — случились ли неполадки до или после нарушения воздушного пространства Эстонии? Ответ может дать только «черный ящик». Обломки самолета лежат на дне, но у эстонцев нет технических возможностей их поднять. Россия предлагает свою помощь в поисках «черного ящика», однако эстонская сторона предложение отклоняет.
В больницу небольшого портового города попадает польский турист с признаками тяжелого отравления ипритом. Примерно в то же время рыболовное судно подцепляет тралом бочку с ипритом времён второй мировой войны. Происходит это в районе предстоящих работ по прокладке газопровода. В районе, тщательно обследованном на этот предмет. Расследованием случившегося занимается ФСБ. Какая связь существует между этими событиями?
В рамках проекта «Второе дыхание» учёными Военно-Морского Флота России разработан уникальный препарат, позволяющий значительно увеличить время пребывания под водой без акваланга. Разведывательные службы США стремятся заполучить образцы этого препарата. «Тайфуны» призваны им помешать.
В Иране должна состояться нелегальная встреча главарей исламистских террористических организаций. ЦРУ разрабатывает план их уничтожения. Встреча должна проходить на уединенной вилле, на берегу Каспийского моря. Проникнуть на территорию можно только со стороны моря. Поэтому американцы обращаются за помощью к своим российским коллегам. В совместной операции с тремя американскими спецназовцами участвуют «тайфуны». Задача — проникнуть на территорию виллы и подорвать находящихся на ней членов руководства террористической организации.
Российский спутник-шпион нового поколения не вышел при запуске на заданную орбиту и затонул в Тихом океане. Система самоуничтожения спутника не сработала, и упал он со всей своей сверхсекретной начинкой в относительно мелком месте, где его нетрудно достать. К месту его падения уже спешит американский военный корабль. С нашей стороны в район падения спутника посылают самолёт с «тайфунами» на борту. Они должны десантироваться и найти спутник, опередив американцев.
Вооружённый преступник опасен. Преступник, прошедший в своё время специальную подготовку и владеющий арсеналом приёмов воина-спецназовца — опаснее во много раз. С такими преступниками умелыми и жестокими предстоит встретиться «тайфунам». Когда-то они были на одной стороне. Когда-то они были своими.
Барса отправляют в командировку на Каспий. Он должен сопровождать комиссию CITES, обследующую на научно-исследовательском судне Каспийский регион на предмет наличия в море осетров. Командировка представлялась Барсу чем-то вроде неожиданного отпуска: лето, море, интеллигентная компания. Он ещё не знал, что очень скоро встретится со своими товарищами по отряду на операции, непосредственно связанной с работой комиссии CITES.
В небольшом приморском городе некто Савченко, имеющий в своём прошлом не одну судимость, создаёт тоталитарную секту, в которую активно вовлекает местную молодёжь. «Религия», исповедуемая отцом Ярополком (так себя именует Савченко), представляет собой дикую мешанину из вульгарного христианства и язычества. Используя в ритуальных обрядах наркотики, Ярополк полностью подчиняет молодежь себе. Место обитания секты — старое заброшенное судно, когда-то севшее на мель неподалёку от берега.
В Африке террористы захватили самолет и попытались направить на крупный город, но самолет с пассажирами потерял управление и рухнул в горах. Специалисты пришли к однозначному выводу, что на борту было оружие. Среди пассажиров оказались выходцы из бывшего СССР. Наши спецслужбы подключились к расследованию. Выяснилось, что за два года до этого рухнул в море еще один самолет и отрядом «Тайфун» был найден неизвестный сплав.
На морском курорте, облюбованном любителями дайвинга, с некоторой периодичностью происходят похожие несчастные случаи. Погибают аквалангисты. Батя оказывается в этом городке в командировке. Он узнает, что среди погибших его старый приятель. Он решает остаться на несколько дней, чтобы разобраться в этом деле. Дело окончательно запутывается, когда единственной подозреваемой остаётся возлюбленная Бати.