Молодой командир Андрей Высотин после окончания военной академии получает назначение на миноносец «Державный». Новоиспеченный капитан корабля встречает своего давнего приятеля Светова, который также является высшим командным чином на Черноморском флоте. Встреча бередит старые раны — когда-то Высотин был влюблен в Свету, которая теперь стала женой Светова. Вновь увидев свою любовь, Андрей понимает, что чувства не остыли. Соперничество двух капитанов выходит за рамки личного и перерастает в противостояние в море.
Приключенческий фильм «Командир корабля» снят по мотивам романа Л. Зайцева и Г. Скульского «В далекой гавани».