Внук профессора Юлиуса Гарольд решил пойти по стопам любимого деда и стать изобретателем. У мальчика есть проблемы со страхом, который в его воображении превращается в огромного монстра. Этот страх мешает Гарольду вести нормальную жизнь и общаться. Когда же в новой академии, где учится мальчик, он встречает Полли МакГрегор, красивую девочку, то решает наконец побороть свой страх. Гарольд пробует новое изобретение профессора Юлиуса, после чего превращается в смелого и безрассудного Джека, свое альтер-эго. Мультфильм «Чокнутый профессор» является сиквелом одноименного фильма 1963 года.