Главный герой — Флэтчер Мансон, офисный работник, работающий под руководством Теодора Азимута Швиттерса. Начальник Флэтчера является лидером секты, по своим убеждениям похожей на саентологию. Все события представлены глазами Мансона, который воспринимает мир не объективно, а сюрреалистично, зачастую уделяя внимание тому, что подразумевается, а не тому, что происходит в реальности. «Шизополис» — экспериментальный фильм Стивена Содерберга, не имеющий четкого сюжета, снятый им по собственному сценарию.