Пять лет назад бывшего оперативника Виктора Пугачева и несколько его коллег по уголовному розыску уволили из-за пропажи важных вещественных доказательств. Все эти годы Пугачев провел за пределами родного Северонефтянска, а теперь решил вернуться и невольно стал «нулевым пациентом», привезя в маленький окруженный горами и лесом городок Covid-19. Болезнь распространяется с бешеной скоростью, городу грозит закрытие на карантин, некоторые жители умирают, а остальные ненавидят и избегают Виктора как виновника эпидемии. В то же время в Северонефтянске растет уровень преступности, который может быть связан с тем, что в соседнем цыганском поселке похищают и сразу же теряют привезенный на сохранение бандитский «общак». Начальник местного уголовного розыска, подполковник Давид Егизарян, понимает, что молодые и неопытные сотрудники Тележкин и Ясенева не справятся с наплывом преступлений, и собирает им в помощь уволенных оперативников — Пугачева, Латникова, Шаталина и Дорогина.
Сериал «Пустые города» — это остросюжетный детектив с Антоном Момотом в главной роли.