Хару Хосино был рожден с признаками обоих полов, однако психологически он чувствует себя больше мальчиком. Герой принимает решение учиться в школе на кондитера, но для этого ему необходимо три года вести себя как девочка. Привычный уклад жизни Хару кардинально меняется, ему непросто в новом образе, а тут еще новая загадочная подруга пытается с ним сблизиться. Ситуация совсем запутывается, когда Хару понимает, что начинает испытывать чувства к футболисту Иноуэ Масахиро.
Сериал «Интерсексуал» снят по мотивам одноименной манги Рокуханы Тиё.