Пользуясь новейшими изобретениями науки и техники, криминалистическая лаборатория ФЭС продолжает свои исследования. Они на своем опыте знают, что идеальных преступлений не бывает. Будь то маньяк или случайный убийца, он все равно оставит след, и оперативникам остается лишь зацепиться за эту ниточку.
Второй сезон вышел уже через несколько месяцев после первого, в 2008 году. В нем почти в три раза больше серий, что доказало растущую популярность сериала у зрителей. В числе новых лиц в сериале появляется Юлия Вайшнур, Елена Головизина и Анастасия Груздева в роли Аллы. А среди режиссеров «След 2» — Камир Закимов («Анна-детективъ»).