Инспектор Амайя Салазар возвращается к работе спустя 4 месяца после рождения сына. В небольшой католической церкви кто-то оставил на алтаре кость детской руки. Расследование заводит Амайю во времена испанской инквизиции.
«Наследие костей» — второй фильм из цикла об Амайе Салазар по мотивам серии книг Долорес Редондо.