События фильма разворачиваются во время летней Олимпиады 1980 года в узбекском городе Джизаке. Подполковник местной милиции Тура Саматов ведет расследование убийства заместителя начальника уголовного розыска Андрея Пака. Чем дальше Саматов продвигается в своем расследовании, тем глубже он проникает в хитросплетенную сеть наркомафии, продажных милиционеров и коррумпированных представителей власти, окутавшую город.
Двухсерийный фильм «Кодекс молчания» имеет 4-серийную телеверсию под названием «На темной стороне луны».