Американский студент Джон Маккензи приезжает в Индию на учебу и поселяется в семье своего друга Васу. Главная научная цель Джона — древний храм, окруженный мистическими легендами. При посещении храма Джон знакомится с его настоятелем Свамиджи, который рассказывает ему легенду возникновения этого места. Джон не верит в сказки, но когда попадает в беду, то первым делом бежит за помощью к Свамиджи. настоятель храма решает сделать Джона невидимым, но магия срабатывает не до конца, и Джон становится крошечного размера. «Крошка Джон» — индийское фэнтези по мотивам древней тамильской легенды.