Столичный врач-невропатолог Игорь Павлович Максимов приезжает в город Нижние Волчки, чтобы работать в местной больнице. Но его профессиональный энтузиазм быстро гаснет — пациентов практически нет, а жизнь в провинции монотонна и скучна. Медсестра Алена, влюблена в доктора, видит, что он собирается возвращаться обратно в Москву. Желая любой ценой задержать Максимова, она обращается за помощью к местному знахарю Василию, который умеет творить волшебство.
«Стоянка поезда — две минуты» — советский музыкальный фильм о столичном враче, который приехал в глухую провинцию.