Военно-историческая драма, рассказывающая о французской оккупации Египта в 1797-1803 годы. «Прощай, Бонапарт» отображает конфликт между традиционализмом и модернизацией. В описанное время Наполеон поручил начальнику инженерного корпуса Каффарелли наладить контакт с местным населением, и тот подошел к делу со всей ответственностью. Француз познакомился с семьей булочника, который нисколько не интересуется политикой. Старший сын мужчины Бакр примыкает к исламским фанатикам, средний — философ Али — интересуется жизнью Запада, а младший Яхья поддается любому влиянию. Когда в стране разгорается конфликт между арабами и европейцами, Каффарелли не знает, на чью сторону ему встать.