События фильма разворачиваются в период Холодной войны. Британский шпион Джон Престон следит за подозреваемым в предательстве сотрудником минобороны Джорджем Беренсоном. Ми-6 считает, что Беренсон завербован СССР и передает секретные сведения врагам. После разоблачения Беренсон соглашается быть двойным агентом. В это время его наблюдатель Престон выходит на агентов, которые пытаются провезти атомную бомбу через границу. «Четвертый протокол» — шпионский кинотриллер по мотивам одноименного романа Фредерика Форсайте.