Месяц назад в Москве произошла вспышка эпидемии неизвестного заболевания со 100% летальным исходом для мужской части населения, девушки же превратились в загадочных и кровожадных существ, мураний. Корпорация «Вершина» одна из первых отреагировала на ситуацию – из города эвакуировали население и ввели карантин. Столица оцеплена военными и обнесена электрическим полем, которое убивает при попытке выйти за его пределы. Корпорация «Вершина» утверждает, что люди, которые не успели эвакуироваться в первый день после введения карантина, погибли. Но на самом деле город полон мураний, а незараженные пытаются выжить. Люди вынуждены прятаться от кровожадных существ и от зачищающих территорию патрулей «Вершины». Выжившие просыпаются утром от неожиданных криков мураний, которые проникли к ним на базу. При осмотре здания выясняется, что кто-то открыл мураньям дверь изнутри. Но кто и зачем отворил дверь? Тем временем в незараженной зоне девушка погибшего журналиста Катерина собирается в Москву за фактами, которые бы подтвердили существование девушек с черными глазами и с желанием убивать. А в лаборатории «Вершины», изучающей особи, появляется необычный экземпляр.
План Валеры о прорыве блокпоста провалился. Корпорация «Вершина» объявляет о начале проекта «Освобождение», всем желающим предлагают пройти процедуру санации, после чего они могут быть свободны. Это предложение раскололо лагерь выживших на две части. Некоторые наивно полагают, что их спасут, а кто-то же, напротив, уверен, что это очередная ловушка. Ника обвиняет Ската в бездействии и мягкотелости и разрывает с ним отношения, но в действительности причина кроется намного глубже — девушка влюблена в другого участника группы и не в силах больше скрывать свои чувства. Неожиданно у базы выживших появляется спецназ «Вершины»… В кого влюблена дерзкая Ника? Кто предаст друзей, чтобы спасти себя?
Марина добровольно отправляется на санацию в лабораторию корпорации «Вершина», после она возвращается на базу, не замечая слежки. Группе выживших приходится экстренно эвакуироваться и искать новое убежище. Журналистка Катя попадает в Москву, где сразу же сталкивается с беспощадными черноглазыми девами. По счастливой случайности девушку спасает Валера. Тем временем Митю похищают жрецы, которые чтят богинь смерти с черными глазами, которые, по их мнению, призваны очистить мир от скверны. Митя организовывает побег из логова жрецов и попадает в ловушку к мураньям, где встречает единственную и неповторимую… А в лаборатории «Вершины» ученые продолжают изучать особь под номером 144, которая обладает уникальными сверхспособностями.
Митя попадает в ловушку к мураниям, среди которых он встречает свою бывшую возлюбленную Надю, которая уводит его в свое логово. Валера приводит на базу выживших новенькую Катю, которая ищет доказательства причастности «Вершины» к созданию и распространению вируса. Валера и Катя отправляются на разведку, чтобы найти запасную базу. Во время вылазки они берут в плен наемника, который собирает капсулы из ушных раковин мураний. Внезапно на базе появляются незваные гости, которые приводят за собой целую стаю мураний.
Надя в поисках своего возлюбленного приводит к базе выживших целую стаю особей, как лабораторных, так и диких. Выжившие обнаруживают, что остались без оружия, кто-то их предал. Взяв удар на себя, Митя уводит мураний с базы. Позже Митя узнает о сущности Нади то, что полностью разрушает его представление о мураниях. А Валере все чаще мерещится Айжан. Напряжение среди выживших нарастает — кто-то украл оружие и отпустил пленника. Ученные из лаборатории «Вершины» отдают приказ патрулю разыскать муранию и человека, на которого она не напала вопреки своей сущности.
Митя потрясен тем, что мурания Надя понимает его и даже пытается общаться. Новенькая Катя предлагает Валере взаимное сотрудничество, девушку интересует любая информация о «Вершине», а взамен она предлагает компрометирующие сведения на одного из группы выживших. Руководство «Вершины» начинает подозревать, что профессор Радомский одновременно с вирусом создал и антивирус, но скрыл это. Валера узнает, что Айжан — одна из подопытных в лаборатории «Вершины». Он принимает решение сдаться...
Лина тайно покидает базу и отправляется на поиски мамы, в городе она едва не становится жертвой мутантки. К Наде возвращается способность понимать и говорить, она приходит в себя и учится контролировать свою суперсилу. Надя пытается принять себя такой, какой ее сделал вирус, но она очень боится навредить Мите. Валера не может смириться с тем, что над Айжан проводят опыты. Он хочет убить ее и прекратить издевательства. В лаборатории «Вершины» Валеру и Айжан помещают в один вольер. Узнает ли Айжан Валеру или его ждет неминуемая гибель? Тем временем Лина находит новый дом, а Лобода сообщает Насте, что он видел, как девочку забрал патруль.
Надя с Митей гуляют по опустевшему городу. Катя следит за ними. Почувствовав девушку, Надя превращается в мутантку. Валера отказывается принимать участие в исследованиях «Вершины», он против опытов над Айжан. Инга Белова, заместитель Хаусхофера, отдает отправить несговорчивого Валеру на санацию. Сотрудники лаборатории обнаруживают, что Валера сбежал, а вместе с ним пропала и особь 144. Валера возвращается на базу выживших, чтобы предупредить о планах зачистки и найти предателя, информирующего «Вершину». Лобода продолжает проводить опыты, которые станут причиной необратимых событий для некоторых из выживших.
Выжившим срочно нужно покидать базу, на которую в скором времени нагрянут патрульные «Вершины». Группа выживших разделяется: Ника уходит с Андреем, который обещает вывезти ее за периметр, а Лобода присоединяется к Валере, который и не подозревает об убийстве Насти и Пети. Валера находит укрытие и перевозит туда Айжан. Алину приютила семейная пара, которая на первый взгляд показалась девочке очень доброжелательной. Теперь же эти милые люди заставляют носить платья их умершей дочери и называют ее Алисой. Надя решает провести эксперимент, она призывает мураний в особняк, чтобы проверить, насколько они ее слушаются, и сможет ли она их контролировать. Большое скопление мутанток настораживает доктора Брыль, он догадывается о причинах скопления и посылает патрульных за альфа-самкой. Валера влюбился в Катю, но как только она приближается к укрытию, Айжан заходится в крике. Валера не может больше ждать и надеяться на то, что Лобода сможет спасти Айжан, он собирается убить ее...
Патрульным «Вершины» не удается прорваться к особняку и взять альфа-самку. Инга Белова понимает, что мистер Хаусхофер ждет от нее результатов, ей ничего не остается, как самой отправиться на переговоры с Надей и Митей. Инга им сообщает, что скоро в город войдут регулярные войска для зачистки территории, все зараженные будут убиты. Надя — это единственный шанс на спасение мутировавших девушек. Митя и Надя соглашаются принять участие в разработке вакцины против вируса. Тем временем в отношениях Айжан и Валеры все не так, как хотелось бы Лободе. Катя приходит попрощаться с Валерой, она отправляется в город на поиски Андрея, с которым она планирует покинуть периметр. В лаборатории «Вершины» Надя устраивает представление для мистера Хаусхофера, а профессор Брыль, изучая биоматериал мутантки, приходит в восторг от увиденного. Наконец, он на пороге великих открытий.
Любовь не мутирует, поэтому Айжан сохранила воспоминания, связанные именно с Валерой. Она все реже приходит в себя из-за того, что чувствует, как теряет связь с любимым, который тайно влюблен в Катю. Лобода заключает его вместе с Айжан, надеясь вернуть былые чувства. По результатам анализов Надя беременна. Возможно, что эмбрион выработал независимую от матери защиту. Неожиданно Надя теряет сознание, а когда приходит в себя, рассказывает Мите о странном сне. Катя обманом добывает видеокопии протоколов санации и разыскивает Андрея, чтобы выбраться за периметр. После разговора с ним Катя понимает, что, возможно, Валера в опасности. Семья, в которую попала Лина, оказывается не такой уж доброжелательной. Они насильно удерживают девочку и заставляют носить одежду погибшей дочери.
Инга приказывает профессору Брыль сделать Наде аборт, чтобы использовать стволовые клетки плода для разработки вакцины. Лобода продолжает держать Валеру в заточении несмотря на то, что это не дает желаемых результатов. Катя, заподозрив Лободу в обмане, готова пожертвовать собственной жизнью, чтобы спасти Валеру. Айжан последний раз приходит в себя, чтобы проститься с любимым. Ника и Андрей, получив данные от информатора в лаборатории «Вершины», готовятся к выезду за периметр. Руст находит прикованную Лину в семье душевнобольных, готовых убить любого, кто попробует отобрать у них «дочь». Надя, узнав о распоряжении Инги, приходит в ярость… Теперь она способна управлять сознанием не только мутанток, но и людей.