НБО сдерживают распространение вируса, но их число и силы слишком малы, чтобы остановить его окончательно, список погибших увеличивается почти после каждой операции. Юдзи попадает под обвал при обрушении здания, и, не имея возможности продолжать бой или бежать, выживает только благодаря своевременному вмешательству Аи. Тем не менее, он попадает в больницу в тяжёлом состоянии.
Наномашины в теле Юдзи блокируют вирус, и он готовится к возвращению в строй. Остальные бойцы НБО тем временем снова сталкиваются с огромным монстром, но расчёт на поддержку со стороны Аи не оправдывается. Её способности слишком нестабильны, и для уничтожения монстра приходится выжечь зажигательной бомбой участок радиусом 2 километра. Вирус мутирует и начинает разрушать наномашины.
М35, новый вирус, способный не только разрушать наномашины, но и имитировать даваемые ими возможности, окончательно поражает весь состав НБО, кроме Юдзи. CURE безуспешно пытается уничтожить их с помощью роботов, вооружённых автоматическим оружием, ракетами и огнемётами.
Аи вызывают для предотвращения угрозы. Юдзи в очередной раз сбегает из больницы и присоединяется к участвующим в бою НБО. Вертолёт с Аи подбит и стоит прямо в центре опасной зоны. Имитация наноброни позволяет новому гигантскому монстру сопротивляться силе Аи.