После тяжелого ранения Каллен приезжает в офис Морской полиции, который переехал в новое здание. Похищен и убит капитан Френк МакГваер, работавший на штаб морской разведки. В убийстве замешан наркокартель. Команда скоро обнаруживают, что действия капитана МакГваера, возможно, подвергли опасности военную операцию против различных наркокартелей в Мексике. Также пропала племянница капитана.
Сэм чувствует себя преданным, когда узнает, что группа спецназа замешана в проникновении в дом торговца наркотиками и убийстве.
Во время учений на военной базе Кэмп-Пендлтон угнан беспилотный летательный аппаратMQ-1 Predator и ракета AGM-114 Hellfire. Команда вынуждена найти хакера из преступного мира для того, чтобы найти ответы, а также обнаружить ракеты, прежде чем они попадут в руки врага.
Психически неуравновешенный ветераниракской войны прилетает в Лос-Анджелес и убивает человека. В данном деле замешана частная охранная фирма, которая тоже ищет его из-за убийства бизнесмена.
Убит мужчина на водном мотоцикле, который получил заказ от Управления военных разработок. Команда опасается, что его секретные разработки будут потеряны, пока они ищут подозреваемого. Директор Венс прилетает в Лос-Анджелес из-за киллера из Северной Кореи по имени Ли Ван Кай, которая замешана в этом деле. У директора старые счеты с Ли Ван Кай.
Капрал, приписанный ко взводу снабжения на базе Кэмп-Пендлтон, найден мертвым после падения с высокого жилого дома. Полицейские говорят, что это самоубийство, но в скором времени выясняется, что он был убит. Кроме того он был замешан в распространении фальшивых купюр. К расследованию подключается Секретная служба.
На теле убитой девушки обнаружена флешкарта с фотографиями Каллена. Эти фото были сделаны до того, как в него стреляли в пилотной серии. А эта девушка, была последней, кого он видел перед ранением.
В то время, как Хетти посещает сенатские слушания в Вашингтоне, убит резервист морской пехоты. Келлен пытается внедриться в военизированную группировку, что вызывает гнев Хетти. Каллен попадает в заложники.
Когда морской инженер был убит, команда считает, что мотивом может быть международный шпионаж, но они в шоке, когда судмедэксперт Эбби Шуто приезжает в Лос-Анджелес с информацией, что это может быть серийный убийца, которого она называет Призраком. Она также утверждает, что его уникальность в том, что он не оставляет никаких улик. Эбби похищена, Каллен и команда должны торопиться, чтобы спасти жизнь Эбби и остановить убийцу.
Троих ветеранов из роты морских саперов попытались взорвать, один из них умер от взрывного устройства вмонтированного в сотовый телефон, улики приводят команду к покалеченному ветерану, который замешан в убийстве в Ираке.