Крот, 2-й сезон

После встречи с Окуневым Кузьмичев провожает его в отель, где Окунев вскоре умирает при загадочных обстоятельствах. Следователь Конюшин подозревает Кузьмичева в причастности к его гибели и арестовывает его. Толпа скинхедов устраивает погром на рынке, во время которого там был замечен Грязнов.

Кузьмичева выпускают из изолятора в связи с отсутствием доказательств. Позже Кузьмичев выясняет, что следователь Конюшин действовал по заказу Куликова, вице-мэра Москвы и друга Маргеладзе. Вскоре Куликов найден мертвым в собственном доме.

Людьми Маргеладзе в одной из психушек найдена пропавшая Марина, бывший финансист Кузьмичева. Маргеладзе решает продать эту информацию Кузьмичеву. В этой же больнице лежит двойник Кузьмичева Архипов. Сын Грязнова «Грэг», являющийся наркоманом со стажем, похищает сына Нины Пантелеевой с целью получения выкупа.

Кузьмичев просит Сабура, находящегося в СИЗО, о помощи в поисках похитителей Никиты Пантелеева, взамен предлагая помощь в досрочном освобождении. Происходит встреча Кузьмичева и Цапфика, помощника Сабура, который предлагает ему возглавить империю Сабура. Спецслужбы обещают Кузьмичеву поддержку в данном направлении.

В Сибирск вылетает финансист Костя для подписания договора с местным олигархом Линником. Между похитителями Никиты в загородном доме происходит ссора, в результате которой Грэг убивает организатора похищения Кулька и возвращает Никиту матери. Бывшая жена Кузьмичева Анна убивает своего мужа Илью, являвшегося сотрудником спецслужб и оказывается в СИЗО.

Кузьмичеву предложено войти в совет националистического движения «Великая Россия», состоящего из скинхедов. Кузьмичев решает внедрить туда своего человека для получения информации. В Сибирске возникает роман между Костей и Оксаной, приехавшей из Москвы. Во время их прогулки по городу неизвестные нападают на Костю и сбрасывают его в реку.

Едва живого Костю спас Антон, живущий отшельником на острове. Позже выясняется, что Антон — не простой охотник. Адвокат Лерр решает продать Маргеладзе информацию о том, что Кузьмичев действует под прикрытием спецслужб.

Виктор Сергеевич предлагает главврачу психушки устранить Марину. Тот просит время на раздумье, а сам решает бежать вместе с Мариной и Архиповым. Но это становится известно Виктору Сергеевичу, и он с помощью скинхедов расправляется с ними. После очередной встречи Кузьмичев решительно отказывается сотрудничать с движением скинхедов «Великая Россия». Тогда Виктор Сергеевич разрабатывает план похищения сына Кузьмичева для получения выкупа.

Адвокат Лерр встречается с сотрудником ФСБ для получения информации о сотрудничестве Кузьмичева со спецслужбами. Кузьмичев передает Маргеладзе информацию о том, как Лерр шантажирует высокопоставленного военного офицера, незаконно торгующего оружием.

Вышедший из тюрьмы Сабур назначает встречу Кузьмичеву, на которой рассказывает, что ему известно о его сотрудничестве со спецслужбами и об утечке информации о наркотиках.