События мультфильма «Фрегат „Полундра“» разворачиваются на Земле, где назревает экологическая катастрофа. Планета не справляется с объемами мусора, и профессор Крамер с помощью одаренного подростка Макса пытается бороться с ним своими изобретениями. Случайно Макс приводит в действие устройство, оживляющее мусор. Судно, которое должно собирать в океане выброшенные отходы, становится опасным пиратским кораблем под предводительством коварного капитана Дихлофоса, и оживший мусор собирается напасть на прибрежный город. Этому ужасному плану противостоят отважные герои Болтик, Заколка и Очкарик.