Действие фильма разворачивается во времена Второй Мировой войны в Чехословакии. Студент Пражского университета Ян Смудек после концентрационного лагеря делает себе поддельные документы и становится подпольным борцом с оккупантами. Ян разъезжает по стране на автомобиле и в каждом городе через радиосвязь призывает свой народ выступить против врага. Фашисты следуют за неуловимым Яном попятам, но находятся смелые люди, которые ему все время помогают. «Неуловимый Ян» — военный фильм о сопротивлении чехословацкого народа против фашистов.