Агент ФБР Эмили Бирн (Стана Катич) бесследно исчезает во время расследования дела одного из самых известных серийных убийц Бостона. Шесть лет спустя ее, едва живую, находят в хижине в лесу. Эмили ничего не помнит о времени, проведенном в заточении. Она возвращается домой и узнает, что ее муж снова женился и теперь ее сына воспитывает другая женщина. Героиня сериала «Амнезия» пытается принять новую для себя реальность и выяснить, что с ней произошло, однако вскоре Эмили оказывается в эпицентре новых шокирующих убийств.