Действие фильма происходит в январе 1942 года. Японцы захватили крупнейший остров Папуа Новой Гвинеи Новую Британию. На этом острове находилась небольшая католическая миссия, в которой жили несколько австралийских сестер милосердия. Вместе с ранеными солдатами, сестры попали в плен к японцам. Среди монахинь оказались две подруги Береника и Лорна. Чтобы пройти через все испытания, которые выпали на их долю, им пришлось испытывать свою веру на прочность. Драма «Сестры войны» основана на реальных событиях, основанных на дневнике Грейс Крюгер, одной из сестер католической миссии в Новой Британии.