Действие разворачивается в 1944 году. Немецкая шпионская сеть под руководством полковника Бергера ведет активную работу, которая позволит нанести советской армии сокрушительное поражение. Два капитана российской контрразведки — Константин Лавров и Павел Семенов — рискуют жизнью, выполняя самые сложные и опасные задачи, чтобы остановить немцев как за линией фронта, так и в советском тылу.
Военный боевик «СМЕРШ. 1944» — это продолжение сериалов «СМЕРШ» и «СМЕРШ. Продолжение». В каждой новелле герои в исполнении Игоря Петренко и Владислава Котлярского сталкиваются с новыми противниками.