Набожный детектив-мормон Джеб Пайр расследует жестокое преступление: два брата убили жену и маленькую дочку своего третьего младшего брата. Обвиняемые утверждают, что выполняли приказ Бога. Выясняется, что братья состоят в религиозной группировке «Школа пророков» и следуют догматам Движения Святых последних дней, которые среди прочего включают в себя полигамию и убеждение в том, что истинные верующие могут напрямую общаться с богом. Чем глубже детектив Пайр погружается в расследование, тем большему сомнению подвергается его собственная вера.
Сериал «Под знаменем небес» снят по одноименному бестселлеру американского писателя и журналиста Джона Кракауэра. В свою очередь, роман описывает реальные события, произошедшие в штате Юта в 1984 году.