Работая на НКО в Пенамстане, Клэр обнаруживает, что происходящие там события напоминают Раккун-сити. Леон направляется в Белый дом, но не подозревает об угрозе.
Леон с агентами Джейсоном и Шен Мэй берутся за тайную миссию — внедриться в шанхайский научный центр на борту атомной подводной лодки.
В доме одного из последних уцелевших членов отряда Бешеных Псов Клэр ожидает ужасное зрелище. Шен Мэй предупреждает Леона о зловещем заговоре.
Министр обороны Уилсон угрожает Клэр смертью, если она не бросит расследование. Леон и Шен Мэй спешат в огромную подземную лабораторию биологического оружия.