В финале четвертого сезона давний недруг Брагина Гаспаров обвиняет Веру Брагину в преступлении 20-летней давности и отправляет под стражу. В новых сериях уголовное дело в отношении супруги главного героя прекращается, однако личность убийцы по-прежнему не установлена, поэтому расследование продолжается. Тем временем Брагин решает вернуться к работе и намерен восстановиться в прежней должности в Следственном Комитете России, вот только его место уже занято.
В результате Брагин становится обычным следователем в одном из районов Петербурга, где ему, в частности, предстоит заниматься расследованием преступлений прошлых лет. На новом месте службы главный герой узнает, что коллега, который занимал эту должность до него, не уволился, как полагал Брагин, а бесследно исчез. В какой-то момент Брагин понимает, что исчезновение следователя как-то связано с одним из тех дел, которыми он теперь занимается. Вот только как?
Тем временем друг Брагина, полковник полиции Михаил Шибанов, продолжает службу в ГУ МВД по Санкт-Петербургу и Ленинградской области. Он не теряет надежды восстановить отношения со своей бывшей невестой Еленой Ракитиной, которую долгое время считал погибшей, а также хочет помириться с журналисткой Таней Котиковой, перед которой он чувствует вину. Однако Ракитина еще не знает, с каким выбором ей придется столкнуться, когда в жизни Шибанова произойдет неожиданное событие.