Ра-Зефон, 1-й сезон

В очередном бою долему удаётся захватить РаЗефон с Аято и поместить его… Куда? Это похоже на Токио, но ещё больше похоже на кошмарный сон о Токио. Здесь всё привычно, но всё ненастоящее. Здесь могут сбыться сокровенные желания, здесь можно узнать что-то, но ещё здесь невыразимо страшно. Нашёл бы Аято выход без помощи Рэйки? Неизвестно.

Куон спит уже много дней. Похоже, дремлющий в ней Исполнитель готов проснуться. Из Барбем Фандэйшенз прибывают специалисты под управлением Хэлены — давней знакомой Исики и Ицуки. Что-то очень странное происходит с Куон, неведомо как оказавшейся в РаЗефоне во время боя с долемом. Футагами продолжает копать. Он показывает Аято фотоснимок главнокомандующего силами Му в Токио. Это — мать Аято.

Собственное расследование Харуки даёт странный результат: Кисараги Куон появилась неизвестно откуда. Все документы о её прошлом подделаны. В действительности она — «первый человеческий образец», первый чистокровный Му, оказавшийся в руках Барбем Фандейшенз.

ВВС Терра получают новую боевую машину — Вермиллион. Теперь Элви Хадьят может потягаться с долемом один на один. Аято узнаёт, что мутировал. От него скрывали правду, но в разговоре с Элви Хадьят заместитель командующего проговорился, а Аято оказался случайным свидетелем. Теперь ему придётся снова решать, человек ли он, как ему жить дальше и можно ли верить людям, которые так долго его обманывали.

Воспоминания Исики. Оказывается, у этого холодного, больше похожего на робота человека тоже было детство, проведённое в особняке Барбем Фандейшенз с Хэленой и Ицуки. Он был любопытен, умел сочувствовать другим и задавать странные вопросы. Странное детское приключение сильно изменило его. Название отсылает к роману Артура Кларка «Конец детства»

Мэгуми становится офицером Терра. Аято поглощён своими переживаниями — он не чувствует в себе сил жить в этом мире и решает вернуться в Токио. Он хочет узнать правду. С ним в РаЗефоне отправляется и Куон. Название отсылает о японской легенде о принцессе Кагуе.

Побег не остаётся незамеченным. Погоня, попытка остановить беглецов, помощь долема. Приказ вернуть РаЗефон любой ценой позволяет Элви Хадьят и Харуке на Вермиллионе проникнуть в Токио вслед за Аято и Куон.

Аято в Токио. Он у себя дома. Правда, которую никто не собирается скрывать, не делает его жизнь легче. Оказывается, никто не лгал ему — всё так, как говорили там, во внешнем мире. РаЗефон пробуждается. Попытки остановить его ни к чему не приводят. Показав сыну правду, Камино Мая не удерживает его. Аято бежит обратно во внешний мир, вынужденный взять с собой Асахину Хироко. Несчастная девушка, узнавшая об изменении цвета своей крови, не хочет оставаться в Токио — ей страшно. Харуке так и не удаётся догнать Аято — они возвращаются по отдельности.

Вытащив Асахину, Аято пытается как-то устроить её в жизни. Оставив РаЗефон в озере и заметя, насколько возможно, следы, они вдвоём поселяются в отеле и пытаются найти какой-то выход из положения. Странные отношения — оба знают, что Асахина — мулиан, но не говорят об этом друг другу и пытаются вести себя как ни в чём не бывало. Но от реальности не скрыться. Появляется долем, к Аято возвращается РаЗефон, и он идёт драться. Только вот долем этот — долем Асахины, убивая его, Аято, сам не желая того, убивает девушку. Она успевает лишь оставить ему записку с последними «Люблю» и «Прощай».

Аято снова в Терра. Там много нового — после его побега Канаги и Элви Хадьят были отстранены и посажены под домашний арест. Новый командующий — Исики, его личный аналитик — Сито Харука. И ещё одна Харука — курсант, помощник Исики, почему-то ничем не отличающаяся от Мисимы Рэйки. В доме на Нирай Канай появляется Мамору. Бой с долемом приносит новое горе — гибнет Донни, один из пилотов группы Элви Хадьят.

Готовится грандиозная операция по деблокированию Токио Юпитер. Куон встречается с Барбемом. А Мамору показывает своё истинное лицо.

Сито Харука уволена. Мэгуми узнаёт, что Аято и Харука были знакомы ещё очень давно. Операция начинается — барьер с Токио снят, но результат оказывается неожиданным. Летающие крепости Му появляются над всеми крупными городами Земли. Земной Альянс получает ультиматум — либо РаЗефон будет отдан Му, либо города будут уничтожены. Одновременно с исполнителями — Аято и Куон, — встречается Ишитори — душа РаЗефона. Именно она, в образе Мисимы Рэйки помогала Аято, именно она говорила с Куон. Теперь у каждого из них свой РаЗефон и своя Ишитори. Исполнителей зовут в новый мир, который они создадут.

Командующий Канаги возвращается на пост после снятия Исики. Но лишь для того, чтобы объявить эвакуацию Нирай Канай, а самому остаться на острове и принять последний, безнадёжный бой со своим бывшим начальником и нынешним смертельным врагом. Канаги побеждает — Нирай Канай накрывает барьер, аналогичный Токио Юпитер. Аято, чтобы защитить Харуку, соглашается пойти с Иситори.

Терра продолжает бой с Му. Вряд ли кто-то из них не понимает, что в этом бою у них нет шансов. Гибнут корабли, гибнет звено Элви на Вермиллионах, лишь она одна остаётся в живых. Аято возвращается к Харуке, но лишь для того, чтобы расставить точки над i и вновь уйти в бой. На этот раз, возможно — навсегда. Ведь перед стартом Хэлена рассказывает Аято, что тот станет с РаЗефоном единым целым и уже не будет человеком.

Торигай Мамору пытается отомстить Аято за смерть Хироко. Элви Хадьят снова идёт в бой на своём старом истребителе. Предсказание Хэлены сбывается — Аято, соединившись с РаЗефоном, становится богом. Гибнет Элви, гибнет Соючи и оставшийся на корабле экипаж «Лидии Литвяк». Куон со своим РаЗефоном отправляется настраивать мир. РаЗефоны встречаются и приступают к настройке.