Планы Сумеречной Искорки, ставшей Принцессой, по празднованию дня Летнего Солнцестояния приходится отложить в сторону, когда Принцессы Селестия и Луна пропадают без вести. День и ночь разделены на части, Луна и солнце вместе находятся на небе, из Вечнозелёного леса растёт огромное растение, которое разрастается повсюду. Главный подозреваемый — Дискорд, но он утверждает, что абсолютно невиновен. Зебра Зекора покидает свой дом и говорит Искорке, что сделала зелье, но выпить его может только аликорн. Искорка выпивает его и переносится в прошлое, в тот момент, когда Принцесса Луна стала Лунной пони
Искорка видит, как Селестия отправила сестру на луну с помощью древних камней гармонии, потом, ещё раз выпив зелье, она видит тот день, когда Дискорд правил Эквестрией, и как они обратили его в камень. Выясняется, что Элементы Гармонии были взяты принцессами Селестией и Луной у Древа Гармонии в Вечнозелёном Лесу в дозапамятные времена. И теперь, чтобы спасти Эквестрию от растений, Принцесса Искорка и её подруги должны вернуть их Элементы к Древу Гармонии. Шестерых друзей ждёт опасная прогулка по Вечнозелёному лесу в поисках Древа… После того, как Элементы были возвращены на место, Дискорд признается, что именно он являлся виновником этого плюща — еще когда принцессы его свергли с власти.
Нашу шестерку внезапно потянуло в старый замок Селестии и Луны. Искорка хочет узнать побольше о Древе Гармонии из книг библиотеки замка, Рарити зовёт с собой Флаттершай и Энджела на реставрацию старинных гобеленов из замка двух сестёр, чтобы получить от них вдохновение на создание новой линейки одежды, а Эпплджек и Радуга решают прогуляться по мрачному замку ночью, чтобы выяснить кто из них самая храбрая пони.
Все в Эквестрии знают увлекательнейшую приключенческую книгу о Дэринг Ду. Но кто бы мог подумать, что автор этой книги писательница А. К. Йерлинг — и есть Дэринг Ду? И в этом таинственном мире Дэринг, Ауизотла и волшебных ценностей отважная пегаска действительно является спасительницей мира. Но на этот раз ей не обойтись без Радуги Дэш...
Пытаясь получить право нести флаг Понивилля на предстоящих Эквестрийских играх, меткоискатели не согласны со Скуталу, которая считает, что полёт — это самый впечатляющий способ показать свою гордость за Понивилль, но вместе с тем не может научиться летать.
Когда Спайк и шестёрка пони внезапно оказываются супергероями в мире комиксов, единственный путь для них вернуться обратно домой — это победить супер-злодея Mane-iac. И именно Спайк может это сделать, опровергнув мнение о том, что он ни на что не способен.
В счастливый День сбора Яблок фруктовый сад Эпплджек подвергается атаке. За этим скрывается возвращение ужасающих Фруктовых Летучих мышей-вампиров. Эпплджек готова на самые решительные меры ради того, чтобы защитить сад. Сострадательная Флаттершай предлагает гораздо более гуманный план, но никто не поддерживает её, и робкой пегаске приходится поддержать план подруг, использовав Взгляд. Однако это приводит к неожиданным последствиям…
Рарити, взволнованная открывшейся возможностью, отправляется на модное шоу в Мейнхэттен в компании подруг, которые решают разделить с ней это высококлассное приключение в её любимом городе. Но когда другой модельер создаёт копию её линейки одежды, она обращается за помощью к остальным пони из шестёрки, даже не понимая, что её гнев и амбиции могут повредить их общей дружбе.
Пинки делает удивительное открытие, которое может связать меду собой семью Пай и клан Эпплов. Взволнованная больше всех Пинки прыгает на повозку Эпплов, чтобы найти пони, которая будет знать это точно. По пути они должны научиться понимать сильные стороны и недостатки друг друга, чтобы выяснить, что делает семью семьёй.
Радуга Дэш со своей понивилльской командой пребывает в Радужный водопад, чтобы участвовать в квалификационном раунде Эквестрийских Игр. Но очень быстро становится очевидным, что состязание оказывается слишком тяжёлой ношей для них. И тогда, когда элитная команда Клаудсдейла предлагает ей место в своём лучшем отряде, Радуге Дэш предстоит определиться, насколько же простирается её верность.