Спецслужбы получили от одного заключенного сведения, что к берегам США собираются направить корабль с группой террористов. Опытный агент Фрэнки Элрой-Килмер направляется в Джакарту, чтобы получить подтверждение этой информации. Ей необходимо выяснить, что это за террористическая организация и кто ее главарь. После выполнения задания Фрэнки ранят и захватывают в плен. Ее бывший муж Джон, спецагент ФБР, собирает группу «Матрица: Угроза» и вылетает в Джакарту, чтобы уничтожить террористов и вытащить из плена Фрэнки.