Готэм, 5-й сезон

Брюс находит Ведьму. Оказывается, что это Айви. Она обманывает Брюса и убеждает его освободить её, после чего убивает пленивших её горожан. Уэйну удаётся убедить её отдать ему семя древнего растения, которое сможет восстановить позвоночник Селины, но при этом «изменит» её навсегда. Селина съедает семя и возвращает способность ходить, но также приобретает некоторые кошачьи свойства. Гордон и Буллок выслеживают банду, захватившую детей и заставлявших их рыть тоннель из Готэма, спасают всех и отправляют в безопасную зону, а Барбара спасает их от охотников за головами, которые хотели убить Гордона, потому что Кобблпот назначил награду за его голову. Тем временем Нигма просыпается после очередного провала в памяти и понимает, что он похитил бандита из Уличных Демонов, а другие члены этой банды были убиты таким образом, чтобы подозрение пало на Пингвина.

Множество людей Пингвина сбегает от него в безопасную зону, созданную полицией, и Кобблпот отправляется туда во главе армии бандитов, в том числе Уличных Демонов, чтобы всех вернуть. Им удаётся захватить безопасную зону, так как у полиции проблемы с патронами, но затем бандиты пленят самого Пингвина. Ему приходится объединиться с Гордоном, чтобы освободиться и вместе перебить всех бандитов. Тем временем Селина с Брюсом отправляются на поиски Джеремайи Валеска. Они обнаруживают, что Экко вербует новых членов к нему на службу. Селина пытается обмануть её и проникнуть внутрь, прикинувшись сторонницей Джеремайи, но не проходит испытание. После этого Экко сбегает, а Селина приковывает Брюса наручниками и оставляет, чтобы он не мешал ей убить Джеремайю. Неизвестный устраивает взрыв в безопасной зоне, гибнет много горожан, находившихся под защитой полиции.

Джеймс Гордон и Пингвин временно объединяются, чтобы найти виновного во взрыве в безопасной зоне. В поле подозрения попадает Виктор Зсасз, его ловят, но он отказывается признать свою вину. В поисках доказательств Люциус Фокс прибегает к помощи Эдварда Нигмы, работая вместе, они приходят к выводу, что Зсасз невиновен. Нигма продолжает расследование в одиночку и находит свидетельницу, которая сообщает, что виновным во взрыве является он сам (она видела, как Эдвард выстрелил из гранатомёта в безопасную зону той ночью, события которой он не помнит). Пингвин организует «суд линча» над Зсасзом, и разъярённая толпа игнорирует разумные доводы Гордона о невиновности обвиняемого, после чего Джеймс и Харви Буллок освобождают его силой и отпускают. Из-за этого многие горожане перестают поддерживать Гордона, он с горя напивается и проводит ночь с Барбарой. Тем временем Селине Кайл удаётся прокрасться к Джеремайе Валеска и поразить его ножом в туловище.

Эдуардо Дорранс, бывший армейский сослуживец Гордона, прибывает в Готэм с группой военных якобы на помощь. Джеймс обнаруживает, что последним покупавшим гранатомёт у подпольного торговца оружием был Эдвард Нигма и подозревает его во взрыве в безопасной зоне. Горожане ловят Нигму и пытают электричеством, после пары разрядов он восстанавливает в памяти события той ночи, когда взорвались мосты — он вспоминает Освальда, который велел его оживить. Пингвин рассказывает, что по его приказу Нигму оживил Хьюго Стрейндж. Нигма находит Стрейнджа, который рассказывает, что при оживлении имплантировал ему в мозг чип, с помощью которого можно контролировать его разум. Гордон убеждается в невиновности Нигмы. Дорранс признаётся, что именно он всё это время контролировал Нигму, и активирует чип, приказывая Загадочнику преследовать и убить Гордона. Тем временем Селину объявляют героем преступного мира из-за убийства Джеремайи, и она разрывает отношения с Брюсом. Зрителям показывают, что Джеремайя пережил нападение Селины и готовит исполнение некоего плана, целью которого является Брюс Уэйн.

Нигма, ведомый приказами, передаваемыми через чип внутри его головы, нападает на Гордона, но тому удаётся отбиться и закоротить чип в голове Нигмы при помощи электрошока. Эдуардо Дорранс сам пытается поймать Джеймса, но тому удаётся сбежать при помощи Барбары и Эдварда. Люди Дорранса начинают убивать заключённых бандитов и запирают сопротивляющихся полицейских. Люциус удаляет чип из головы Нигмы. Эдуардо шантажирует Гордона, взяв в заложники Ли Томпкинс. Во время попытки обмена Ли на чип из головы Эдварда Гордон вступает в схватку с Доррансом и в итоге толкает того на металлический прут, который протыкает его туловище. Нигма, Брюс, Альфред, Барбара и Люциус объединяются, чтобы освободить полицейских из заключения людей Дорранса в участке. Им удаётся сделать это, а также отправить информацию из чипа Нигмы (компромат на Дорранса) прессе вне Готэма. Ли не помнит ничего из случившегося за последние 3 месяца. Оказывается, что Хьюго Стрейндж при воскрешении имплантировал чип в мозг Ли так же, как и Нигме. Уокер лично прибывает в Готэм, спасает жизнь Эдуардо при помощи специального газа и отдаёт Ли приказ убить Джеймса. Ему с помощью электричества удаётся отключить её чип. Барбара шокирует Гордона известием, что она беременна. Джеремайя нападает и захватывает Альфреда. Тем временем Пингвин подвергается ограблению со стороны воровки Сороки, и, чтобы поймать её, обращается за помощью к Селине. Они идут в убежище Сороки, но та запирает их в комнате с бомбами. Селина понимает, что Пингвин собирается бежать из Готэма во внешний мир, и соглашается помочь Кобблпоту в обмен на 10 % накопленных им драгоценностей. Сорока попадает в ловушку, и Пингвин хладнокровно добивает её.

Гордон разговаривает по рации с генералом вне Готэма, тот говорит, что после бегства Уокер теперь ничего не мешает начать воссоединение Готэма со внешним миром. Поиски Альфреда за 5 дней так ни к чему и не привели, а полицейские находят трупы людей, погибших от воздействия химикатов. След приводит Гордона и Ли Томпкинс в Нэрроуз, на завод компании Эйс Кемикалс, где множество загипнотизированных бандитов производят химикаты под управлением Джервиса Тетча и Экко. Тем временем Джеремайя Валеска заманивает Брюса Уэйна в ловушку при помощи двойников его погибших матери и отца, а также Альфреда, находящихся под гипнозом. Особняк Уэйнов взрывается, но Брюс и Альфред успевают убежать. Селина и Барбара решают обмануть Пингвина и отомстить ему за убийство Табиты, но, встретив Альфреда, Селина передумывает и спешит на помощь к Брюсу. Джеремайя убивает двойников родителей Брюса и угрожает, что сделает то же самое с Джеймсом и Ли. Появившаяся Селина останавливает его в последний момент, но Экко запускает таймер распыления большого количества химикатов. Гордону удаётся утопить грузовик с химикатами в реке до детонации, но вещество начинает распространяться по воде, и из-за угрозы заражения воссоединение Готэма со внешним миром откладывается на неопределённый срок. Брюс дерётся с Джеремайей на заводе, и тот падает в чан с химикатами. Лишившись поддержки Селины, Пингвин приходит за помощью к Загадочнику и предлагает тому вместе сбежать из Готэма. Они убеждают Барбару не убивать Кобблпота, чтобы сбежать вместе с ними из города на подводной лодке. Ли прощает Гордона, и они воссоединяются.

Человек, который выглядит как отставной полицейский Дикс, бывший напарник Харви, совершает двойное убийство в клубе Барбары. Расследуя преступление, Гордон и Буллок приходят домой к Диксу, куда вскоре приходит и убийца, лицо которого имеет полное сходство с лицом Дикса. Выясняется, что 20 лет назад группа полицейских посадила женщину за убийство мужа, а сейчас её дочь (которая в результате экспериментов Хьюго Стрейнджа получила способность перенимать внешность других людей после прикосновения к ним) мстит им за то, что они заставили её оговорить мать. Приняв внешность Харви, девушка убивает Дикса. Буллок предлагает девушке решить дело миром, но та отказывается, и он вынужден застрелить её. Пингвин и Загадочник подвергаются нападению мистера Пенна и его второй личности, воплощённой в кукле-марионетке по имени Лицо со шрамом. Напавшие требуют отдать им драгоценности, накопленные Кобблпотом на случай побега из города. В результате борьбы Пингвин убивает Лицо со шрамом, а Нигма — Пенна. Тем временем Брюс и Альфред расследуют исчезновения людей в туннелях под городом и узнают, что за ними стоит человек, мутировавший под воздействием химикатов. Вдвоём они одолевают мутанта, но спасти живым удаётся только одного пропавшего человека.

Гордон и группа полицейских приходят в цитадель Пингвина на переговоры с представителями всех преступных кланов Готэма. Джеймс предлагает заключить соглашение о прекращении огня, чтобы сохранить жизни людей до воссоединения со внешним миром. Бандиты готовы согласиться, но неожиданно в Гордона стреляет неизвестный. Пока Ли Томпкинс оперирует его, Харви берёт руководство полицией в свои руки и пытается найти покушавшегося. Ему удаётся выяснить, что пуля, которой ранили Гордона, принадлежала Виктору Зсасзу. Альфред помогает поймать Зсасза, и тот признаётся, что покушался на Гордона, находясь под контролем Айви Пеппер. Раненный Гордон испытывает галлюцинации, в которых он выступает в ролях обвиняемого и обвинителя на судебном заседании, переживая за все свои ошибки, в том числе за жизни людей, доверившихся ему и погибших в результате взрыва в безопасной зоне. Барбара отравляет глав преступных кланов и заставляет их согласиться на прекращение огня в обмен на противоядие. Тем временем Брюс и Селина собираются на свидание и едят консервы. Внезапно приходит Айви и при помощи галлюциногенов берёт Брюса под свой контроль. По воле Айви, он приходит к Люциусу и пытается заставить того прекратить работы по очищению реки от токсинов, выпущенных Джеремайей Валеска, чтобы препятствовать воссоединению Готэма со внешним миром и отдать город природе. Появившаяся Селина успевает остановить их в последний момент. Айви приходит в полицейский участок, выпускает Зсасза и нападает на Ли. Серьёзными совместными усилиями нападение удаётся отразить — Ли ранит Айви, после чего та убегает, Харви обезоруживает Зсасза, а Джеймс очнулся. Через месяц Гордон и Ли сочетаются законным браком.

Тереза Уокер при помощи Хьюго Стрейнджа возвращает Эдуардо Дорранса к жизни, попутно преображая его. В Готэме готовятся к долгожданному воссоединению со внешним миром. Люди прибывшего генерала Уэйда перепроверяют уровень токсинов и утверждают план воссоединения, но в этот момент полицейский участок подвергается нападению группы бойцов во главе с Эдуардо, который стал гораздо более физически сильным под воздействием химикатов и теперь зовёт себя Бейн. Он похищает Гордона, Брюса Уэйна и генерала Уэйда и начинает избивать Джеймса на глазах Брюса. Тем временем Загадочник завершает создание подводной лодки, он с Пингвином и Барбарой собираются покинуть город, но на пристани у Барбары начинаются схватки, и она уезжает в роддом. Кобблпот и Нигма решают обмануть её и уплыть вдвоём, но у них это не получается, так как Барбара заранее украла клапан регулятора давления от подлодки, чтобы избежать обмана со стороны сообщников. Уокер признаётся Брюсу, что её настоящее имя — Нисса Аль Гул, она дочь Рас Аль Гула, а всё, происходившее с Готэмом в последнее время — наказание Брюсу за убийство её отца. Она также хочет наказать Барбару, которая помогла Брюсу убить Раса, и посылает Бейна за ней. В роддоме Ли, Пингвин и Нигма пытаются защитить Барбару от нападения, а тем временем Хьюго Стрейндж хочет прооперировать Гордона так же, как Эдуардо. Нигма возвращает клапан от подлодки, и они с Пингвином сбегают. Брюс и Джеймс вырываются из заключения людей Ниссы вместе с генералом Уэйдом, не зная, что Стрейндж имплантировал ему в мозг чип для контроля. Барбара рожает дочь. Бейн избивает Селину и серьёзно ранит Альфреда. Контролируемый через чип Ниссой генерал Уэйд отдаёт приказ о бомбардировке и уничтожении Готэма. Барбара возвращается в свой клуб с родившейся дочерью и находит там трупы всех подчинявшихся ей членов сестринства Лиги Теней, а также встречает Ниссу Аль Гул.

Нисса Аль Гул собирается забрать новорождённую дочь Барбары, чтобы воспитать её как члена семьи Аль Гул, и велит генералу Уэйду отдать войскам приказ атаковать Готэм и уничтожить всех оставшихся жителей. Пингвин и Загадочник собираются уплыть на подводной лодке с накопленными драгоценностями, но на пристани Освальд внезапно передумывает, решая «следовать зову сердца», и остаётся в городе, присоединяясь к обороне, которую организовал Гордон. Нигма тоже передумывает и решает остаться, также к обороне присоединяется Брюс с новейшим оружием, которое ему дал Люциус Фокс. Небольшая группа полицейских и вооружённых горожан обороняет баррикаду от многочисленных солдат под командованием Бейна. В ходе боя из-за взрыва гранаты Кобблпот лишается глаза. Обороняющиеся отступают под напором превосходящих сил противника. Брюс и Селина взрывают последнюю оставшуюся бомбу Джеремайи в здании Уэйн Энтерпрайзис, чтобы обрушившееся здание преградило путь наступающей армии. Тем временем Гордон освобождает Барбару, но Нисса заставляет его сложить оружие, угрожая убийством дочери. Она хочет убить Джеймса на глазах Барбары и избивает его. Барбаре удаётся освободиться и убить людей Ниссы, а затем ранить её саму тем самым кинжалом, которым был убит её отец. Раненая Нисса приказывает генералу Уэйду застрелиться, чтобы тот не мог отменить приказ войскам об уничтожении Готэма. Бейн нападает на Брюса и Селину, но тем удаётся отбиться от него при помощи стаи летучих мышей. Солдаты окружают полицейский участок и готовятся к штурму. Гордон отправляет беженцев и Барбару с ребёнком уходить по подземному туннелю, а сам с оставшимися полицейскими обороняется и прикрывает отход. Неожиданно все беженцы возвращаются и встают рядом с полицейскими. Солдаты отказываются выполнять приказ стрелять в невооружённых горожан и берут в плен людей Бейна и его самого. Нисса уплывает из Готэма на подводной лодке Загадочника с драгоценностями и псом Пингвина. Воссоединение Готэма со внешним миром наконец-то происходит. Барбара решает назвать дочь Барбара Ли Гордон. Загадочник и Пингвин объединяются, чтобы вместе построить преступную империю и заполучить контроль над городом. Джеймса Гордона назначают комиссаром полиции Готэма. Брюс Уэйн уезжает из города, оставив Селине прощальное письмо и попрощавшись с Альфредом.