Действие происходит в Одессе в 1905 году. Братья Петя и Павлик Бачей возвращаются с летнего отдыха в город. Все лето они провели в «экономии» (поместье, сдаваемое владельцем на лето дачникам), и революционные события 1905 года прошли в буквальном смысле этого слова мимо них — волной черного дыма броненосца «Потемкин» и Черноморского флота на морском горизонте. По дороге мальчики и их отец спасают от преследователей беглого матроса-потемкинца Родиона Жукова, пробирающегося тайком из Румынии в Одессу. В Аккермане (ныне Белгород-Днестровский) семья пересаживается на пароход, идущий в Одессу. На этом же пароходе Петя снова встречает матроса. Но кроме матроса на судне находится и сыщик, выследивший преступника и собирающийся его арестовать по прибытии в Одессу. Матросу удается сбежать, спрыгнув с парохода в море и поплыв в сторону берега. Сыщик, пострадавший при попытке задержания, был вынужден дожидаться причаливания корабля. Матрос с трудом доплыл до рыбацких шаланд и стал тонуть, но его спас старик-рыбак и его внук — Гаврик. Матрос серьезно заболел, но его вылечили, приютив на время выздоровления в рыбацкий хижине на берегу Черного моря. Этот матрос с маленькой татуировкой на руке в виде синего якоря будет не раз встречаться по сюжету всех четырех произведений, вошедших в эпопею «Волны Черного моря».
В этом фильме вы встретитесь со своими давними знакомыми — мальчиками Петей Бачеем и Гавриком Черноиваненко, теперь уже выросшими и вступившими в пору зрелости, матросом-потемкинцем Родионом Жуковым, учителем Василием Петровичем — отцом Пети, славными бойцами революции — большевиками-черноморцами. Время, показанное в фильме, полно напряженных, подлинно драматических событий.
Прошло около двадцати пяти лет. Петя Бачей, или, как его теперь называют, Петр Васильевич, человек средних лет с небольшой сединой в висках, довольно известный юрист, вместе со своим сыном, пионером Петей, в один прекрасный летний день летели на рейсовом пассажирском самолете из Москвы в Одессу.
В их планы неожиданно вмешалась война. Посадив Петю на последнюю автомашину, отправляющуюся в Одессу, Бачей уходит на фронт, не рассчитывая на скорую встречу с родными. Но судьба непредсказуема: отец и сын вновь встретились, но уже в одесских катакомбах. Здесь, глубоко под землей, среди вечного мрака и сырости, жили партизаны, сражавшиеся с врагом, оккупировавшим Одессу.