Однажды Сакура-кун приходит к себе домой и обнаруживает, что в его комнате поселилась девочка Докуро, являющаяся ангелом из будущего. Чуть позже он сталкивается с другим ангелом, Сабатой, чья цель — убить его, так как в будущем Сакура должен изобрести некое средство, останавливающее старение девушек в возрасте 12 лет, что идет вразрез с интересами неба. Как выясняется, Докуро была послана с той же целью, однако пошла против своего начальства и решила помешать открытию Сакуры, не убивая его самого. «Убойный ангел Докуро-тян» — черная комедия, пародирующая такие сериалы, как «Эльфийская песнь» и «Я стану ангелом!».