Токио. 2023 год. Очередной технологический прогресс не за горами. Мир стал более развитым, общество — более образованным. Однако ситуация с преступностью все еще не решена. Злодеи используют последние достижения науки в корыстных целях. Они грабят и убивают, их не остановить. Для того чтобы максимально снизить уровень преступности, правительство формирует отряд особого назначения. В группу борцов с преступностью входят только специально обученные девушки, для которых мир, закон и справедливость превыше всего.
Аниме «Спецотряд «Burn-Up» является ремейком сериалов «Burn Up W» и «Burn Up Excess», в котором сохранены многие персонажи из них, но сюжетная линия отличается.