Действие сериала «Школа «Черная дыра» разворачивается в вымышленной школе-интернате Блейка Холси, где «Научный клуб» (пять учеников и их преподаватель) исследует загадочные явления, большинство из которых связано с чёрной дырой, расположенной на территории школы. Здесь может случиться всё, что угодно: вода, стекающая по стенам, произвольное самовозгорание парт, учителей засасывает в воронку, ученики превращаются в магнит или становятся невидимыми… Здесь случаются странные вещи, и «Научный клуб» стремится узнать, что же происходит на самом деле. Имеют ли отношение к этой тайне чёрная дыра, летающий шарик и «Пэ́рэдайн И́ндастриз» — лаборатория, разрушенная несколько лет назад как раз рядом со школой? Никто не знает. Но, несмотря на пристальный интерес бывшего владельца «Пэрэдайн», под бдительным взглядом директрисы Дёрст ребята вместе с эксцентричным и неподражаемым профессором Захари втайне расследуют эти странные события.