Главный герой сериала «Батюшка» — сорокалетний моряк Роман Малышев, всю свою жизнь отдавший флоту и теперь оказавшийся в долгосрочном вынужденном отпуске. Лишившись необходимости каждый день нести свою службу, он уезжает в родное село Рыбное, где видит заброшенный храм и бросает свои силы на его восстановление. На глазах Романа и при его непосредственном участии начинает медленно возрождаться и православная община в селе, пробуждается приходская жизнь: к живому, зримому делу тянутся односельчане. Храм преображается на глазах: тюремные камеры снова становятся церковными помещениями, у храма появляется купол, постепенно возводится звонница, поднимаются колокола. Параллельно с этим подобные изменения происходят и в жизни Романа. Трудясь на благо возрождения святилища, герой находит свой путь к Богу и обретает веру.