Физиология вулканцев обязательно требует выхода сексуальной энергии организма раз в семь лет. В этот период они становятся несколько неспокойными. У Спока начался этот процесс.
«Энтерпрайз» встречается с древнегреческим божеством — Аполлоном, который живет на заброшенной планетке и мечтает вернуть прошедшие времена, когда толпы верующих поклонялись ему, великому и могучему, а он раздавал им свою любовь и бесконечную мудрость.
Зонд «Странник», который был запущен с Земли в начале XXI века, запамятовал свою первоначальную задачу — исследование космоса, и теперь наоборот стремится к уничтожению всего «несовершенного».
Ионный шторм сбивает настройку транспортеров, в результате чего Кирк, Скотти, Ухура и Маккой попадают в альтернативную вселенную. Там Федерация — не оплот мира и любви в галактике, а жестокий диктатор, на корню пресекающий все демократические попытки других цивилизаций.
Кажущийся рай, обнаруженный командой «Энтерпрайза» на Гамма Триангули VI, на самом деле управляется компьютером, который, не желая вмешательства в свои дела извне, пытается уничтожить «Энтерпрайз».
Гигантский корабль-робот, кочующий по галактике, уничтожает любую жизнь на своем пути. Пути корабля и «Энтерпрайза» сходятся.
На очередной исследуемой планете «Энтерпрайз» обнаруживает созданий, которые с помощью «элементарной магии» способны вытворять вещи, выходящие за грань понимания Кирка и его команды.
Снова «Энтерпрайз» сталкивается с андроидами, цели которых далеки от направленных на пользу человечеству. Хотя появление Гарри Мадда, старого знакомого Кирка, должно уже все объяснить.
Кирк с товарищами попадают на небольшую планетку, где живет отшельник Зефрам Кохрейн (изобретатель варп-двигателя), которого оберегает некая нематериальная жизненная форма, названная им Компаньоном. Это существо заботится о нем и угождает всем его желаниям, в частности, когда он начал тосковать от одиночества, оно привело к нему Кирка, Спока и Маккоя.
Убит один из послов независимых планет, которых «Энтерпрайз» везет на мирную конференцию. Подозрение падает на Сарека, посла планеты Вулкан, а также отца Спока.