Мужская работа, 2-й сезон

Пасечнику удалось освободить Лешего из заключения. Шахов, занимающий высокий пост в правительстве, добивается разрешения на прибытие судна «Гринпис» в Россию. Члены данной организации намереваются посетить форум МАГАТЭ на Ленинградской АЭС. Все это вызывает подозрения у генералов ГРУ. Принято решение о внедрении Пасечника в службу охраны Шахова.

С помощью грамотно организованной подставы Пасечнику удается устроиться к Шахову в службу охраны. Ему сразу же удалось обнаружить «жучки» в рабочем кабинете. Леший отправляется в Таджикистан для расследования пропажи военного вертолета и поисков предателя среди пограничников.

Произошла встреча Шахова с Али, во время которой тот потребовал скорейшей доставки наркотиков из Таджикистана. Аль-Саид решает избавиться от Шахова как от лишнего и опасного свидетеля. В Таджикистане силами пограничников проведена успешная операция по поимке нарушителей — наркокурьеров.

В штабе ГРУ получена видеозапись казни Гюрзы. Пасечник и Пономарев не верят в подлинность записи. Во время празднования юбилея Островского совершается покушение на Шахова. Пасечнику удается вовремя застрелить киллера. На Лешего и Ислама готовилось покушение. Но Леший вовремя засек стрелка.

Помощник Шахова Федоров пытался отравить его, но Пасечник уронил на пол чашку с отравленным кофе. В Душанбе убит подполковник Сокольский, которого Леший подозревал в организации похищения вертолета. Шахов решает бежать за границу и просит Пасечника помочь ему.

Федоров предлагает Пасечнику передать ему Шахова. У Натальи пропадает Рустам, усыновленный ею в Чечне. Пономарев показывает Пасечнику видеозапись с камеры наблюдения. На ней Пасечник узнал Руслана. На поезде, перевозящем груз с наркотиками, в ходе следования было заменено сопровождение. Ростов помогает Наталье найти Рустама. Пасечник засекает слежку за Шаховым во время следования в аэропорт. Он избавляется от преследования, но Шахов передумывает бежать.

На Лешего и Ислама совершено нападение во время поездки на заставу. Во время перестрелки Ислам случайно застрелил нападавшего. Пасечник и Пономарев решают разыскать Гюрзу, проверяя гостиницы. Шахов застрелился на собственной даче. Пасечник нашел гостиницу, где остановился Гюрза. В Санкт-Петербурге задержан Ваха с подельниками, направлявшимися на атомную станцию.

Состоялся телефонный разговор Пасечника и Гюрзы. Пасечник нашел заброшенный пионерский лагерь, в котором тренировались боевики, но был захвачен в плен. Дочь депутата Островского умирает от передозировки наркотиков. В Москве задержан литерный поезд из Таджикистана с партией наркотиков.