В старинной католической школе для девочек стали происходить странные вещи. Несколько учениц школы бесследно исчезли, а одну из них нашли мертвой. В школу приезжает заместитель шерифа города Джек Гейтс, который должен расследовать трагедию. Но, прибыв на место, Гейтс узнает, что тело девушки уже похоронили, не оставив никаких улик. Джек начинает подозревать заговор сотрудников школы, которые всячески поддерживают в ученицах мысль о том, что в здании живет дух бывшей настоятельницы, мстящей нерадивым грешницам за непослушание.
«Смертельные грехи» — фильм-слешер о женской католической школе, в которой происходит череда жестоких убийств.