В 1929 году японцы держат под контролем Корею. Талантливый следователь японской оккупационной полиции Ли Джон-чхуль узнает, что подпольная организация планирует теракт в самом центре Сеула и с этой целью перевозит динамит из Шанхая. Эта информация ставит героя фильма «Секретный агент» в тупик. Ведь Ли Джон-чхуль и сам в прошлом подпольщик, а потому очень хорошо понимает этих людей и их мотивацию. В то же время, разумеется, он не может допустить, чтобы из-за их действий погибли ни в чем не повинные люди.