Картина о последних днях Иисуса Христа и попытка по-новому взглянуть на историю Иуды Искариота. После длительного аскетического существования Иисус возвращается к членам своего сообщества с помощью своего верного ученика Иуды. Он также показывает себя верным помощником и преданным хранителем слов своего Учителя, когда Иисус изгоняет торговцев из Храма. Есть в фильме «История Иуды» и третий персонаж — Карабас, собирательный образ действительно существовавшего юродивого Карабаса Филонского из Александрии и библейского разбойника Вараввы.