Команда Тайн отправляется в «Загадочный круиз» по Бермудскому треугольнику. Во время поездки они поднимают на борт терпящего бедствие моряка по имени Руперт Гарсия, который рассказывает невероятную историю. Он плыл на корабле астрокартографов, который взял на абордаж корабль-призрак, управляемый мертвецами. Гарсии никто не поверил, кроме Команды Тайн, ведь они с такими вещами часто сталкиваются! Скуби Ду и его друзья берутся за расследование тайны корабля-призрака. «Скуби-Ду! Пираты на борту!» — полнометражный мультфильм о приключениях Скуби Ду в Бермудском треугольнике.