1941 год, начинается Великая Отечественная война, наступают трудные времена, красноармейцы вынуждены отступать. Секретарь райкома Степан Кочет (Василий Ванин) занимается эвакуацией и отдает распоряжения относительно уничтожения имущества, вывезти которое все равно не удастся. Под его началом формируется партизанский отряд, которому удается отбить у фашистов пленного танкиста Орлова. Впоследствии окажется, что на самом деле он — немецкий шпион. В 1943 году фильм «Секретарь райкома» получил Сталинскую премию второй степени.