Незадачливый отец-одиночка Фрэнкс (Билл Мюррей) случайно глотает злодейский вирус под названием Трэкс, который грозится уничтожить мужчину всего за несколько часов. Но о Фрэнке есть кому позаботиться, хотя сам он этого не подозревает…. В мгновение ока внутренние органы героя предстают перед зрителями в ином свете: бактерии и клетки становятся полноценными жителями огромного мегаполиса внутри человеческого тела. Одноклеточный герой нашего времени Осмосис Джонс — одинокий полицейский, следящий за порядком во вверенном ему теле — берется за устранение страшной эпидемии, разразившейся по вине Трэкса.