Беззаботная жизнь Фрэнки Пейдж из Питтсбурга рушится в один миг, когда на ее теле начинают появляться кровоточащие раны — так называемые «стигматы». Девушке, которую меньше всего заботят вопросы о Боге, приходится задуматься о своей вере. Помочь несчастной берется молодой священник Эндрю Кернан, бывший биолог, а ныне член Ордена иезуитов. По заданию Ватикана он расследует случаи проявления чудес и знакомится с Фрэнки. Одновременно с этим другой священнослужитель — коррумпированный кардинал Хаусмен — выясняет, что девушка выбрана для передачи пророчества, которое способно навредить официальной церкви. Он хочет заставить Фрэнки замолчать, но Кернан помогает героине в борьбе за истину.